Hợp tác nghiên cứu, đào tạo và trao đổi thông tin với nhiều cơ quan, tổ chức quốc tế trên các lĩnh vực khoa học của ngành y tế:

• Tổ chức Y tế Thế giới (WHO)
• Quỹ Nhi Đồng Liên hợp quốc tại Việt Nam (UNICEF - Vietnam)
• Ngân hàng Thế Giới (WB)
• Ngân hàng Phát triển Châu Á (ADB)
• Khối Cộng đồng chung Châu Âu EC
• Tổ chức hỗ trợ phát triển Australia (AusAID)
• Tổ chức hỗ trợ phát triển Bộ Ngoại giao Hoa Kỳ (USAID), Trung tâm kiểm soát dịch bệnh Hoa Kỳ (CDC)
• Atlantic Philanthrophies (Mỹ)
• Pathfinder, Orbis
• Cơ quan Liên hợp quốc về phòng chống ma tuý (UNDCP)
• Tổ chức Sức khoẻ gia đình quốc tế (FHI)
• Tổ chức Mạng lưới các cơ sở thực địa dịch tễ học Quốc tế (INDEPTH)
• Tổ chức phát triển quốc tế Thuỵ Điển (SIDA)
• Ford Foundation
• Viện Karolinska - Thuỵ Điển
• Viện Nghiên cứu phát triển Vương quốc Anh (IDS)
• London School of Tropical Medicine (Anh)
• Đại học Queensland,Đại học New South Wales, Đại học Melbourne - Úc
• Đại học Thượng Hải, Đại học Shandong (Trung Quốc)